Mặc dù là loại phương tiện có nhiều ưu đãi nhưng nhiều năm qua, tình trạng thiếu bến bãi cho xe buýt ở khu vực TP HCM vẫn chưa được giải quyết. Với hàng chục ngàn các phương tiện, nhu cầu diện tích bến bãi dành cho xe buýt được quy hoạch khoảng hơn 80 ha nhưng thực tế chỉ có khoảng chưa tới 30 ha. Nhiều chủ phương tiện xe buýt buộc phải đậu dưới lòng, lề đường hay những bến bãi tự phát khác.