Ông Nguyễn Văn Khương đã có khuyết điểm, vi phạm trong lãnh đạo và thực hiện quy định của Đảng và Nhà nước về công tác cán bộ, thiếu trách nhiệm trong chỉ đạo kiểm tra, giám sát việc thực hiện của các cơ quan tham mưu, dẫn đến việc đánh giá, nhận xét, điều động, luân chuyển, bổ nhiệm, giới thiệu cán bộ ứng cử một số trường hợp không đúng quy định.