Trong thời gian 3 năm (2018 - 2020), Công ty TNHH MTV Thủy lợi Nam Nghệ An đã để xảy ra một số sai phạm. Trong đó có nhiều nội dung liên quan đến quyết toán chi phí vụ Đông, một số dự án nạo vét hồ… và bị Thanh tra tỉnh Nghệ An đề nghị thu hồi hơn 2,2 tỷ đồng.