Theo Phó Thủ tướng Vương Đình Huệ, dự án Ngã Ba Huế được thực hiện theo hình thức BT nhưng khi dự án đi vào hoạt động từ năm 2015 nhưng các cơ quan nhà nước chưa thanh toán tiền. Khi làm kế hoạch đầu tư công trung hạn 2016 - 2020 thì các cơ quan chưa tính khoản nợ này vào nên không có nguồn chi trả.
